Près de 2000 agents d'IA analysent un atlas génétique du cerveau de souris en 32 minutes

OpenAI, PerturbAI et Scripps Research ont utilisé près de 2000 agents d'intelligence artificielle pour analyser un vaste jeu de données sur le cerveau de souris en seulement 32 minutes, selon des résultats publiés mercredi dans un preprint sur bioRxiv qui n'a pas encore fait l'objet d'une relecture par les pairs. Les agents fonctionnaient sur GPT-Rosalind, un modèle conçu spécifiquement pour la recherche en sciences de la vie.

Les données sous-jacentes proviennent d'un atlas CRISPR du cerveau entier élaboré par PerturbAI, dans lequel des gènes individuels ont été désactivés un à un chez des souris pour montrer comment chaque modification affecte différents types de cellules cérébrales. Un agent a été affecté à chaque perturbation génique. Chaque agent a examiné la réaction des cellules, parcouru la littérature scientifique et proposé des explications mécanistiques possibles. Tous les rapports ont ensuite été fusionnés en un atlas de raisonnement unifié reliant gènes, effets cellulaires, articles de recherche et mécanismes biologiques probables.

Selon les estimations de l'équipe, si des chercheurs humains avaient dû accomplir la même tâche manuellement, cela aurait pris de plusieurs mois à un an. Lors d'évaluations en aveugle, des experts indépendants ont préféré les rapports du système multi-agents à ceux produits par un agent unique dans 75 % des cas. Le système multi-agents a également cité plus de 700 références lors de sa charge de travail la plus importante, contre seulement 11 pour un agent unique.

Parmi les nouvelles pistes identifiées : la perturbation de Tsc2 a modifié des dizaines de gènes liés à la communication entre neurones dans le cervelet, tandis que la perturbation de Tsc1 n'a entraîné que peu de changements — un écart potentiellement pertinent pour la sclérose tubéreuse. Dans une autre découverte, la désactivation de Dctn1, un gène associé à la maladie cérébrale rare appelée syndrome de Perry, a augmenté l'activité de gènes impliqués dans la production de cholestérol, ce qui a conduit à proposer des expériences en laboratoire pour tester son rôle dans les lésions des cellules nerveuses.

L'atlas de raisonnement est accessible publiquement sur GitHub, et le jeu de données sous-jacent est disponible sur Hugging Face.