Почти 2000 ИИ-агентов проанализировали генетический атлас мозга мыши за 32 минуты

OpenAI, PerturbAI и Scripps Research использовали почти 2000 ИИ-агентов для анализа крупного набора данных о мозге мышей всего за 32 минуты — результаты были опубликованы в среду в препринте на bioRxiv, который пока не прошёл рецензирование. Агенты работали на базе GPT-Rosalind — модели, созданной специально для исследований в области биологических наук.

Исходные данные взяты из атласа CRISPR всего мозга, созданного PerturbAI: в нём отдельные гены у мышей по очереди отключались, чтобы показать, как каждое такое изменение влияет на разные типы клеток мозга. На каждое отключение гена назначался отдельный агент. Каждый агент изучал, как реагировали клетки, искал информацию в научной литературе и предлагал возможные объяснения механизмов. Затем все отчёты объединялись в единый «атлас рассуждений», связывающий гены, клеточные эффекты, научные публикации и вероятные биологические механизмы.

По оценке команды, если бы ту же работу вручную выполняли учёные-люди, это заняло бы от нескольких месяцев до года. В слепых экспертных оценках независимые специалисты в 75% случаев отдавали предпочтение отчётам многоагентной системы перед отчётами, подготовленными одним агентом. При максимальной нагрузке многоагентная система ссылалась более чем на 700 источников — против всего 11 у одного агента.

Среди новых выводов: отключение гена Tsc2 изменило работу десятков генов, связанных с передачей сигналов между нервными клетками в мозжечке, тогда как отключение гена Tsc1 почти не повлияло на их активность — этот разрыв может иметь значение для понимания туберозного склероза. В другом случае отключение гена Dctn1, связанного с редким заболеванием мозга — синдромом Перри, — повысило активность генов, отвечающих за выработку холестерина, что натолкнуло исследователей на мысль о лабораторных экспериментах для проверки его роли в повреждении нервных клеток.

«Атлас рассуждений» находится в открытом доступе на GitHub, а исходный набор данных — на Hugging Face.