Майже 2000 ІІ-агентів проаналізували генетичний атлас мозку миші за 32 хвилини

OpenAI, PerturbAI та Scripps Research використали майже 2000 ІІ-агентів, щоб проаналізувати великий набір даних про мозок миші всього за 32 хвилини. Результати були опубліковані в середу в препринті на bioRxiv, який ще не пройшов рецензування. Агенти працювали на базі GPT-Rosalind — моделі, створеної спеціально для досліджень у галузі наук про життя.

Вихідні дані походять з атласу CRISPR всього мозку, створеного PerturbAI, у якому окремі гени миші вимикалися по одному, щоб показати, як кожна зміна впливає на різні типи клітин мозку. Кожному агенту було призначено одне порушення гена. Кожен агент досліджував, як реагували клітини, опрацьовував наукову літературу та пропонував можливі механістичні пояснення. Потім усі звіти об'єднали в єдиний атлас міркувань, що пов'язує гени, клітинні ефекти, наукові публікації та ймовірні біологічні механізми.

За оцінкою команди, якби таку ж роботу виконували вручну люди-дослідники, це зайняло б від кількох місяців до року. У «сліпих» оцінках незалежні експерти у 75% випадків віддавали перевагу звітам мультиагентної системи над звітами, підготовленими одним агентом. За найбільшого навантаження мультиагентна система також послалася на понад 700 джерел — проти лише 11 у одного агента.

Серед нових виявлених напрямів: порушення роботи гена Tsc2 змінило десятки генів, пов'язаних зі зв'язком між нервовими клітинами в мозочку, тоді як порушення роботи гена Tsc1 спричинило незначні зміни — розрив, який потенційно може бути важливим для туберозного склерозу. В іншому випадку вимкнення гена Dctn1, пов'язаного з рідкісним захворюванням мозку — синдромом Перрі, підвищило активність генів, що беруть участь у виробленні холестерину, що стало підставою для запропонованих лабораторних експериментів для перевірки його ролі в ушкодженні нервових клітин.

Атлас міркувань у відкритому доступі на GitHub, а вихідний набір даних — на Hugging Face.